流脑的特点是起病急、病情重、变化多、传播快、流行广、来势凶猛、病死率高、危害性大，所以必须切实做好预防工作。预防流脑发生的最根本措施是及时接种Ａ＋Ｃ流脑疫苗，较高的Ａ＋Ｃ流脑疫苗接种覆盖率可迅速提高该群体对流脑的免疫水平，可有效预防Ａ型和Ｃ型流脑的发生或爆发。无论既往是否接种过Ａ群流脑疫苗，均对Ｃ群流脑缺乏抵抗力，所以，凡未接种过Ａ＋Ｃ流脑疫苗的所有人员，均是Ｃ群流脑容易侵袭的对象。由Ａ＋Ｃ流脑疫苗接种后２周才具有抵抗力，一般应在每年的11、12月接受一次疫苗注射，这样就可以有一年的免疫效果。初对５岁以内儿童接种流脑疫苗，保护率可达80～90％，抗病能力可维持１年左右；以后每年再打加强针一次。
本病的预防主要是早期发现病人及时隔离直至症状消失，居室通风好，消毒衣物。对带菌者给予药物治疗。对可疑病人应予观察或治疗。可用磺胺嘧啶2g／日，小儿100mg／kg／日，分2次服用，同时用等量碳酸氢钠口服，连用3～5天，或者用磺胺异恩暖，成人每次2片，口服，儿童酌减，连服3～5天。流行期外出带口罩，减少集会，加强人群集中区的预防工作。目前国内仍采用磺胺药作大规模预防，但国外已采用利福平或二甲胺四环素，或两药合用。
1、发现病人，早确诊、早报告、早隔离、早治疗。病人须隔离至症状消失后3日，但不少于发病后7日。加强对疫情单位和地区的疫情监视，接触者医学观察7日；对上感、鼻咽炎、皮肤粘膜出现瘀点的疑病似病人均应给予足量的磺胺嘧啶治疗，疗程5天。
2、流行期间做好卫生宣传，注意个人和环境卫生，保持室内空气流通、新鲜，勤洗晒衣服和被褥，可以杀死环境中的病原菌。因为脑膜炎双球菌比较脆弱，它对干燥、湿热、寒冷和一般消毒剂极为敏感，在小于37°C或高于50°C的环境均容易死亡。
3、在流行病高峰季节里，如果发现孩子有发热、咽喉肿痛、头痛、咳嗽、呕吐、精神不好、皮肤出血点等症状应及时去医院诊治。不要探视流脑病人或疑似病人，不要带孩子到病人家去串门，尽量不带孩子去公共场所如商店、影剧院、公园等游玩；如非去不可，应戴上口罩，免增加感染机会。
4、对与流脑患者有密切接触的易感者和可疑者，要给予及时、正确的服用磺胺类药物，进行预防性服药，防服药要在医生指导下进行。小儿要按时进行预防接种，这也是防止流脑发生的重要措施。
5、注意保暖，预防感冒。感冒时病人抵抗力会降低，容易受到流脑病菌的袭击而发病。因此，要随天气变化，随时增减衣服。在剧烈运动或从事劳动后，应及时把汗水擦干，穿好衣服。夜间睡觉时要盖好被子，对儿童更应留意这个问题。
6、对于某些有本病流行的机构团体或与患者密切接触者，成人每日2g，儿童75～100mg/kg/日，分2次，与等量碳酸氢钠同服，共3日。其次可用2～3%黄连素、0.3%呋喃西林液，1：3000杜米芬，0.25%氯霉素液滴鼻或喷喉。每日2次，连3日。
8、各级各类学校一旦发现可疑的流脑病例，要及时向当地疾病预防控制机构报告，并尽快将病人送往正规医院接受规范治疗。
9、有流脑疫情发生的学校，要对流脑患者的密切接触者或一般接触者（同班或同校学生、教职员工、与患者密切接触的其他人员）选用磺胺类药物进行预防性服药，药要规范，一次不漏。减少大型集会和大的集体活动，
10、各级各类学校及学生平时要做好流脑的的一般性预防措施。坚持开窗通风、勤晒衣被、勤洗澡、勤剪指甲，注意保暖，加强锻炼；合理搭配饮食、增加营养、增强抵抗力；有条件应该每天用毛巾浸泡“ ８４”消毒液（1：4配比）后，擦桌椅板凳，或用其喷洒地面。每次打扫前应用清水喷洒地面，以避免细菌随粉尘吸入体内；
11、发生疫情的学校，要每天坚持晨检（检查有无发热和缺席的学生，并调查其原因）
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